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              cytoscape软件 V3.8.1 官方最新版cytoscape软件 V3.8.1 官方最新版

              软件大小:161.7M

              软件官网:HomePage

              用户评分:

              软件类型:国产软件

              运行环境:WinAll

              软件语言:简体中文

              软件分类:其它行业

              更新时间:2020/11/7

              授权方式:免费软件

              插件情况:无 插 件

              平台检测 无插件 360通过 腾讯通过 金山通过 瑞星通过
              软件标签: 其它行业

              cytoscape是一款免费开源的网络软件,其主要功能是帮助用户集成、分析可视化数据,对于专业的网络人员来说比较适用,而且还可以直接连接到外部公共数据库,并能导入网络和注释数据。

              cytoscape下载预览图

              功能特色

              公共数据库客户端

              Cytoscape是作为一个网络服务客户端工作的,这意味着Cytoscape可以直接连接外部公共数据库,导入网络和注释数据。这意味着Cytoscape可以直接连接到外部公共数据库,并导入网络和注释数据。目前,我们支持Pathway Commons, IntAct, BioMart和NCBI Entrez Gene。我们还将继续为热门数据库开发新的服务客户端。

              互操作性

              由于Cytoscape支持导入/导出标准文件格式,你可以很容易地将Cytoscape放入你的工作流程中。例如,如果你有一个由 igraph 或 Bioconductor 生成的网络数据,Cytoscape 可以将该文件以文本表的形式加载,并以 PSI-MI 格式导出,供其他生物信息学工具或你自己的应用程序/脚本使用。

              从 3.3 版本开始,Cytoscape 支持 RESTful API 的编程访问。你可以使用你选择的编程语言来访问Cytoscape的核心功能,如创建网络,应用布局,或图像导出。

              会话文件

              你可以通过一键保存你的工作。所有的设置、数据文件和可视化都打包在一个会话文件中。它被称为Cytoscape会话(.cys)文件。Cytoscape 会话文件包括网络、属性(节点/边缘/网络)、桌面状态(选择/隐藏节点和边缘、窗口大小)、属性、一些插件状态和可视化风格。

              布局

              在二维空间布局网络。 有多种布局算法可供选择,包括循环、树形、力导向、边缘加权和yFiles有机布局。您也可以使用类似于其他图形应用程序用户界面的手动布局工具。

              更新日志

              更快的渲染速度

              提高了渲染性能,并优化了与大型网络的交互。Cytoscape现在为多达10,000个节点和3,000,000条边的网络提供了交互式用户体验。

              新的面板选项

              你的Cytoscape工作空间现在可以通过新的工作空间面板系统来定制你的可用屏幕空间。面板现在可以最小化,设置为浮动,或停靠在工作空间中。

              自定义工具栏

              您现在可以选择项目何时出现在工具栏中,减少杂乱无章的情况,并让您快速访问最常用的工具。

              更新的分析器应用程序

              网络分析器的核心应用程序已经重新设计。改进了用户界面,并增加了对Cytoscape自动化的支持,以便于从脚本和分析工作流中访问。

              标签重新定位工具

              现在可以在网络视图中快速直观地定位标签。

              CyBrowser JavaFX更新

              CyBrowser,Cytoscape 的网页浏览器,已经更新为使用 JavaFX 13。CyBrowser现在与现代网页和应用程序有更大的兼容性。

              用户评论

              (您的评论需要经过审核才能显示)5人参与,5条评论
              140

              最新评论

              • 置顶 甘肃白银移动 网友 啃猪蹄的小仙女

                多谢!!

              • 置顶 山西晋中电信 网友 清絮

                用起来更放心啦

              • 置顶 浙江舟山电信 网友 我沿着悲伤

                好工具,感谢分享!!

              • 置顶 河北保定移动 网友 奶油味软萌

                谢谢分享厉害了

              • 置顶 河南开封电信 网友 等过春秋

                这软件好用,奥力给

              我要抢沙发

              请简要描述您遇到的错误,我们将尽快予以修订

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